Investigadores de la universidad de Stanford con la aprobación del FDA (Federal Drug Administration) de los EE.UU. secuenciaron el ARN de la vacuna de Moderna y la publicaron en Github. Si, como lo oyen, el código genético de la vacuna de Moderna fue publicado en Github por investigadores de la Universidad de Stanford.

Lo extraño es que Github es un repositorio diseñado para alojar código para programas de computación. ¿Es posible usar Github para guardar el código genético de una vacuna?

Una de las ventajas de Github es que permite almacenar información en repositorios públicos. Esto quiere decir que la secuencia de la vacuna de moderna está disponible para todo aquel que desee investigarlo. Con esta noticia nos surge una multitud de dudas como:

• ¿Qué significa esto para la producción de vacunas?
• ¿Cuál es la finalidad que persigue secuenciar el ARN de la vacuna y publicarlo?
• ¿Podrán con esa información realizar versiones nuevas de la vacuna?
• ¿Qué es Github y por qué fue seleccionado para almacenar el código de la vacuna?
• ¿Cómo se usa para guardar el código genético de una vacuna si Github es una herramienta para programadores de software?

Sin duda hay cientos preguntas que nos surgen ante una noticia tan extraña. Pero antes de seguir haciéndonos preguntas conozcamos un poco que es Github.

¿Qué es Github y qué es Git?

Uno de los grandes problemas que tenían los programadores de software en los años noventa era manejar el código fuente de su programa. El código fuente es el código que escribe el programador. Este código luego es procesado por un “programa compilador” para crear programa que podemos correr en nuestros computadores.

Hacia finales de los 90 ya existían sistemas para gestionar las versiones de código pago, que podían ser ofrecidos gratuitamente a algunos programadores. Antes de 2002 las actualizaciones del Kernel de Linux se realizaban manual.

En 2002, una alianza entre Linus Torvalds y BitKeeper les permitió al equipo de Linux el uso de un sistema de gestión de versiones moderno. Pero esta relación se deterioró y en 2005 BitKeeper le retiro el uso gratuito de su herramienta.

Bajo estas circunstancias, Linus Torvalds y el equipo de Linux decidieron desarrollar un sistema de gestión de versiones propio. Posteriormente entregarían este sistema de manera gratuita a todos los programadores del mundo. Así nació Git y actualmente es el sistema de gestión de versiones más usado del mundo.

Basado en Git nació Github, uno de los servicios de alojamiento en la nube de versiones y que veremos a continuación

¿Por qué publicar el código de la vacuna de moderna en Github?

Github es el servicio de hospedaje de código fuente de software de mayor popularidad del mundo. Este hosting permite almacenar el código fuente usando el sistema de control de versiones Git. De esta manera los programadores en distintas partes del mundo pueden colaborar en el desarrollo de una aplicación o librería de software.

El sistema de control de versiones permite a los programadores llevar el historial de cambios de un programa. De esta manera cada programador puede realizar aportes y se pueden incorporar dichos cambios después de un proceso de verificación.

El nombre de GitHub tiene su origen en el sistema Git desarrollado por Linus Torvalds. De esta manera Linus Torvalds se ha convertido en uno de los programadores que más aportes ha realizado al sector de la programación moderna, y en especial al movimiento del Software Libre.

La ventaja de Github es que permite almacenar proyectos públicos de manera gratuita. De la misma manera permite a las grandes empresas publicar sus códigos en repositorios privados.

Github siendo un repositorio público y gratuito (siempre que no pretendas hacer privado tu código) es una alternativa ideal para publicar información. Estas son algunas de las razones de su selección.

También podríamos ver en el futuro que Github sirva para publicar otras informaciones similares. Recordemos que las vacunas van cambiando y así se podrían publicar versiones de las variantes del coronavirus haciendo un “control de versiones”.

Github podría convertirse en una manera de intercambiar información sobre las nuevas vacunas, sus modificaciones y las nuevas variantes del virus.

Sin duda un uso innovador de la tecnología informática en beneficio de la tecnología médica.

A continuación explicaremos por qué los investigadores decidieron código de la vacuna de Moderna publicado en Github.

¿Podremos generar nuestras propias vacunas en casa con el código de la vacuna?

El proceso de elaboración de una vacuna es complejo. Requiere maquinas especiales y procesos que no se pueden replicar en nuestra cocina. Es así como esta información no necesariamente nos es útil a todas las personas. Pero de la misma manera puede resultar muy importante para los investigadores médicos.

Cada cierto número de pruebas de coronavirus se realizar una secuenciación de ADN y/o ARN. Esto sirve para determinar la variante del coronavirus a la cual nos enfrentamos. Es por ello que oímos hablar de la variante británica, brasileña o sudafricana. Esto se debe a que al evaluar las muestras se secuencia en ADN o ARN con la finalidad de saber si hay una nueva mutación o es un “enemigo conocido”.

Pero cuando se secuencia la muestra también podemos estar secuenciando el código genético de la vacuna. Con El código de la vacuna de Moderna publicado en Github, los investigadores determinarán si se encuentran frente a una nueva mutación del virus o simplemente al material genético de la vacuna.

Y es que Github actualmente también se está usando para distribuir la información de contagios. En Github podemos encontrar el repositorio de datos sobre Covid de la Universidad John Hopkins. Github se está convirtiendo en una manera genial de compartir información pública.

El código de la vacuna de Moderna publicado en Github de evitará resultados positivos falsos.  Una forma innovadora para intercambiar información que esperamos que ayude a mitigar resultados falsos.

Esperamos que en un futuro la publicación del código genético de las vacunas y los virus ayude a rastrear las variantes del coronavirus y a desarrollar nuevas y mejores vacunas.